箱式豆芽机系列是把豆芽生长过程控制在恒温恒湿环境中成长，只要有水有电就可以，它会自动进水停水，并加热到设定值时会自动定时淋水，箱体温度与空气温度都可以自动调节，人只需把泡好的豆种放入机器内和取出成熟的豆芽。
豆种的选择应购买当年完全成熟的新鲜豆种，颗粒均匀饱满，色泽鲜艳，无破瓣，无缺损，无虫害，无霉变，无挂丝等为宜，中颗粒芽豆为佳。
一、漂洗豆种
将豆种用自来水或井水洗净。
二、泡豆
1、用30度的温水泡豆，水温调节好后，将豆种上下左右搅拌，做到无死角（加水量是豆种的2倍）。
2、等十分钟后开始漂豆，将豆种内的残豆、嫩豆、杂物漂净为止（冬天需要覆盖保温）。每小时搅动一次，到4小时左右豆种泡好为止，将豆种放入箱内入机。
三、入机
1、先把机器内的菜从上往下搬移，做到新入豆种在上边，要出产的菜在下边（可以防止新泡好的豆种受到待出菜的影响）。
2、将豆种放入机器后，将淋水间隔调至200分钟，淋水时间调至40秒，水温调至21°（夏季为20°），机内恒温调至19°（夏季18°），芽箱温度调至30-35°，然后关门即可。